Dr. Diego Ariel - Aula 06 - Como realizar uma metanálise: R e o RStudio

Espero que estejam gostando do curso...

Essa é nossa sexta aula da série “Como realizar uma metanálise: um guia prático passo a passo utilizando o software R e o RStudio”.

Após os conceitos fundamentais de metanálise e estatística, finalmente conheceremos as ferramentas / softwares necessários para metanalisar. Além de conhecer, aprenderemos como baixar e instalar eles.

Em breve, lançaremos mais cursos nessa “pegada”....

Agradeço demais pela interação de todos... e qualquer coisa, estou às ordens...

Metanálise no R

O R é um software estatístico programável, gratuito/livre, com enfoque em análise de dados. Consiste em uma plataforma na qual podem ser instalados os chamados “pacotes” (semelhantes a aplicativos) para executar determinadas funções. Existem milhares de pacotes com diferentes funções implementadas, sem falar das colaborações dos usuários que o software recebe. O presente guia utilizará o pacote (“aplicativo”) meta, o qual é suficiente para uma boa e simples metanálise.

Instalando o R

Primeiro passo é acessar a página www.r-project.org e no menu da esquerda, em download, escolher a alternativa “CRAN”. Agora escolha qualquer um dos CRAN mirrors, de preferência algum do Brasil (ex: http://cran.fiocruz.br/ ). Isso irá redirecionar para uma das páginas de download do software. Em “Download and Install R”, escolha a plataforma desejada (Linux, Mac, Windows), realize o download do instalador (Latest release) e o execute.

O R não é um software com uma interface amigável. Algumas operações básicas podem ser laboriosas. Dessa forma, nosso segundo passo é instalar um outro software: o RStudio. O RStudio fornece uma boa interface para importação e visualização de arquivos, instalação de pacotes e exportação de gráficos. De maneira análoga simplista, é como se o software R fosse uma espécie de “Prompt de Comando” e o RStudio uma espécie de “sistema Windows”. Para o download do R Studio, acesse a seguinte página: http://www.rstudio.com/products/rstudio/download/ e em “Installers for ALL Platforms” escolha a plataforma mais adequada (Windows, Mac ou Linux) e execute a instalação. O RStudio não é obrigatório ser instalado, mas como dito acima ele otimiza bastante o tempo durante uma metanálise. Existem as versões free e a paga, sendo que a versão free é suficiente para o básico que estamos propondo.

Como dito acima, o pacote que utilizaremos em nossa metanálise é o “meta”. Para instalar o meta (Figura 1), abra o RStudio (lembrar de instalar o R antes), (A) clique em Packages; (B) clique em Install; (C) Será aberta a caixa para instalação e então escreva o nome meta. Clique em install e após instalar, se certifique que o pacote meta está habilitado, ou seja, com o “check” na caixa ao lado de seu nome. A instalação do pacote é necessária apenas uma vez, contudo sempre que for reiniciar o RStudio, é necessário habilitar o pacote marcando essa opção na caixa (Figura 2).

Figura 1. Instalando o pacote meta.