Dr. Diego Ariel - Aula 09 - Como realizar uma metanálise: Criando o Forest Plot

Primeiramente, espero que tenham gostado do curso...

Essa é nossa última aula da série “Como realizar uma metanálise: um guia prático passo a passo utilizando o software R e o RStudio”.

Enfim, nossa última aula... :( Vimos os conceitos básicos e as ferramentas necessárias para rodar uma metanálise. Realizamos juntos 2 tipos de metanálise. E agora finalizaremos com "chave de ouro": veremos como criar e ditar Fores Plot no Rstudio.

Em breve, lançaremos mais cursos nessa “pegada”....

Agradeço demais pela interação de todos... e qualquer coisa, estou às ordens...

Criando um Forest Plot:

Para criar o forest plot da metanálise utiliza-se o comando forest. Ao digitar forest (nome da metanálise) , o RStudio irá criar um forest plot da metanálise. Nesse caso digite no console:

forest (metanalisetestex)

Caso queira omitir no gráfico do forest plot o resultado/diamante do modelo fixo (Figura 1), defina o argumento comb.fixed como falso, digitando no console a seguinte linha de comando:

forest (metanalisetestex, comb.fixed=FALSE)

Figura 1. Forest plot da metanálise do exemplo 1 no modelo de efeito aleatório (teste x para estabilidade de 2 técnicas cirúrgicas, A e B).

A conclusão dos dados da metanálise do exemplo 1 é que o risco é menor da ocorrência de permanência de instabilidade (teste x positivo) no grupo Experimental (técnica A), RR=0,5965 (“arredondado” para 0,60 no forest plot) (Figura 2). Podemos dizer que a utilização da técnica A reduziu próximo a 40% (1-RR) a incidência de instabilidade medida pelo teste x no pós operatório, comparado com a técnica B [Risco Relativo (RR) de 0,5965; intervalo de confiança no nível 95% (95% IC) entre 0,4313 e 0,8250; e p-value de 0,0018 (no modelo de efeito aleatório). A estatística I² indica não heterogeneidade entre os estudos (I²=0,0%, com p-value do teste de heterogeneidade de 0,8170).

Figura 2. Forest plot da metanálise do exemplo 1 no modelo de efeito aleatório demonstrando vantagem para a técnica A, com RR de 0,6 (teste x para estabilidade de 2 técnicas cirúrgicas, A e B).

Edição Básica do Forest Plot

Como vimos, para cria um forest plot no RStudio basta digitar na linha de comando forest e entre os parênteses colocar o nome da variável que atribuímos à nossa metanálise, no caso metanalisetestex no exemplo 1. O RStudio fornece inúmeras formas de editar o forest plot. Basta que, dentro dos parênteses, após o nome da variável que atribuímos à nossa metanálise seja colocado uma “virgula” (,) e o argumento correspondente ao que desejamos editar no forest plot. Salientamos que podem ser feitas inúmeras edições no mesmo forest plot, basta seguir a sequência “vírgula” (,) e o argumento. Por exemplo, se quisermos que o forest plot do exemplo 1 (testex) omita o diamante do resultado do modelo de efeito fixo e que o diamante do modelo de efeito aleatório seja da cor azul, meu comando será:

forest (metanalisetestex, comb.fixed=FALSE, col.diamond = “blue”)

Na tabela, vão alguns comandos úteis para editar o forest plot (lembrando que os comandos são no idioma inglês):

Tabela. Comandos para edição do forest plot no RStudio. Seguir a sequência: forest (nome da metanálise, comando 1, comando 2, comando 3, ..., comando n).

Comando	Função
test.overall = TRUE	Exibe o p-value (que determina a significância estatística do estudo) e o valor Z (“cálculo da largura” do diamante) nos modelos fixo e aleatório
fixed=FALSE	Omitir no gráfico o resultado/diamante do modelo fixo
random = FALSE	Omitir no gráfico o resultado/diamante do modelo aleatório
col.diamond = “blue”	Muda a cor do diamante (o padrão é cinza). Colocar entre as “aspas” a cor desejada, em inglês. No exemplo está blue
label.e = "Medicamento A"	Muda o nome dado aos grupos experimentais dos estudos (o padrão é Experimental). Colocar entre as “aspas” o nome desejado. No exemplo está Medicamento A
label.c = "Medicamento B"	Muda o nome dado aos grupos controles dos estudos (o padrão é Control). Colocar entre as “aspas” o nome desejado. No exemplo está Medicamento B
xlab = "Favorece A - Favorece B"	Coloca um texto abaixo do eixo X (horizontal). Colocar entre as “aspas” o nome desejado. No exemplo está Favorece A - Favorece B